重庆高校药物工程研究中心由重庆市教育委员会批准，依托重庆医科大学，与重庆医药工业研究院和太极集团联合组建而成，具有产学研搭配紧密、发展优势明显、人才资源丰富等特点。在重庆市教育委员会及依托单位的大力支持下，通过不断创新和实践新药研发及产业化的模式，经过初创期的整合磨砺、创业期的完善与发展，在药物研究与开发、人才培养和社会服务方面均取得了突出的成绩。重庆高校药物工程研究中心日常工作由管委会领导，设主任1名，副主任2名，主要技术人员62人。另平行设立技术委员会作为技术咨询机构，由科研院所、企业、医院、监督与检验的15名专家组成。
为实现从新药研发到产业化，中心立足“四个面向”的要求，以国家战略需求为导向，以人民健康为己任，着力开展药学及相关学科的基础研究，实现整合集聚创新资源，努力构建创新能力体系，从基础科学问题出发本周期内重点布局运用生物技术，结合多组学技术和基因编辑开展抗肿瘤新型生物技术药物靶点探索和免疫治疗机制研究。在生物药物开发过程中涉及到的新型给药系统与创新制剂研发、生物药物分析新方法与质量控制研究也都同步在布局和推进。中心在国内外取得了一系列喜人的成果，包括承担NSFC在内的各类科研课题150余项（其中重点任务如下表所示），培养了6位省部级人才，获省部级一等奖、二等奖、三等奖多项，在PNAS、Nat. Commun.等权威杂志发表高水平论文。
近五年，中心共承担国家级项目24项，省部级项目83项，获专利授权182项，获国家或地区和省部级科研成果奖5项，发表论文200余篇，有26项专利或产品实现转化，转让金额2786万元。制定药典标准40个，参与建立行业标准8个。近五年培养博士后6人，指导博士生16人、硕士生320人，培训技术人员及执业药师约10600人次。中心自成立以来，坚持为当地企业或行业提供技术人员培训和技术咨询服务，促进成熟、先进技术的交易与推广，为医药行业的发展做出了巨大的贡献。
